Yerlan

Ищу публикации

87 posts in this topic

В этой теме предлагается собирать и обсуждать все научные работы, касающихся геногеографии в Азии. Преимущественно, эти работы должны быть выполнены на уровне анализа ДНК.

Вместе с этим приветствуются обсуждения работ и на других уровнях: язык, культура, фенология, антропология и т.д.

Share this post


Link to post
Share on other sites

Привожу занимательную статью Велса с соавторами (2001), в эту статью включен сотрудник Института питания в Алмате.

 

http://hpgl.stanford.edu/publications/PNAS..._v98_p10244.pdf

 

Статья называется "Сердце Евразии: Континентальный взгляд на разнообразие Y-хромосомы"

В работе приведены результаты по 49 популяциям состоящих почти из 2,000 мужчин.

В работе использовались 23 снип (SNP) маркеры и маркер YAP (гаплогруппа Д).

Результаты данной работы показывают, что регион Центральной Азии был важным резервуаром генетического разнообразия в Европе, Америке, и в Индии.

 

Сухие слова в абстракте ничего не говорят нам важного, но присмотритесь к таблице и рисункам 1 и 2!

Во 1-х, в работе были использованы анализы по 54 мужчинам из Казахстана.

Естественно, мы не владеем никакой дополнительной информацией по этим образцам, и вряд ли сотрудник Института питания поможет нам в этом.

Во 2-х примечателен рисунок 2. Использование прикладных программ состоящих в пакете PHYLIP позволила авторам статьи cгенерировать кладограмму, где 49 популяций были разбиты на 8 кластеров.

 

И каков результат? На 1ый взгляд странно, но, на мой взгляд, достаточно закономерно: мы генетически очень близки к монголам.

Мы ближе к монголам чем даже к своим тюркоязычным соседям!!! Кроме того, мы в одном кластере с китайцами, японцами, и корейцами.

Наша близость с монголами в основном была предопределана большой частотой образцов с мутацией М48. М48 это основной снип маркер гаплогруппы С3, к которой принадлежит Чингисхан. Подгруппа С3 в свою очередь делится на две ветки: С* и С3с.

Ветка С* считается гипотетической веткой Темуджина. Из 54 казахов 9% образцов оказались в ветке Чингисхана.

 

Рисунок 2 привожу отдельно:

post-3-1173120327_thumb.jpg

 

Если будут вопросы по этой статье, то буду рад вместе с вами разобрать ее.

Share this post


Link to post
Share on other sites

Еще одна статья по нашему региону:

 

http://www.journals.uchicago.edu/AJHG/jour.../013052.web.pdf

 

На этот раз количество образцов казахов использованных в работе было еще меньше, всего 30.

Однако, рисунок 3 снова демонстрирует генетическую близость казахов и монгол.

 

post-3-1173302279_thumb.jpg

Share this post


Link to post
Share on other sites

абстракт взят на одном из русскоязычных сайтов по генеалогии:

 

ПОЛИМОРФИЗМ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК В КАЗАХСКОЙ ПОПУЛЯЦИИ

Березина Г.М. , Святова Г.С. , Абдуллаева А.М. , Бермишева М.А. , Кутуев И. ,

Хуснутдинова Э.К.

Республиканский Центр охраны здоровья матери и ребенка Минздрава Республики Казахстан,

Институт биохимии и генетики УНЦ РАН, Уфа.

 

Материалом исследования послужила ДНК, выделенная из периферической крови 246

казахов (мужчин), собранных у не родственных лиц в популяциях различных регионов Республики

Казахстан. Впервые проведено изучение разнообразия нуклеотидных последовательностей

гипервариабнльного сегмента 1 (ГВСI) митохондриальной ДНК этноса казахов. В исследованной

этнической группе казахов установлен высокий уровень разнообразия гаплотипов мтДНК и

сформированных на их основе гаплогрупп. Полиморфизм контрольного ГВСI мтДНК в казахской

популяции зарегистрирован в 120 сайтах. Было выявлено 38 гаплогрупп мтДНК. Уровень

уникальных гаплотипов составил 64,6% у казахов и сопоставим с некоторыми популяциями Волго

Уральского региона (ВУР) (у чувашей –64%; башкир – 88%; татар – 80%). Индекс

гаплотипического разнообразия у казахов равен 0,99. Аналогичные значения получены для ВУР: у

чувашей и башкир – 0,98, у татар – 0,99. Индекс генного разнообразия, вычисленный по частотам

гаплогрупп, у казахов составил 0,93. Аналогичный показатель по данным литературы в популяции

киргизов составил 0,87, узбеков – 0,92 и таджиков – 0,85 [Голубенко с соавт., 2002].

В ходе исследований было обнаружено, что 58 % мтДНК казахов составили монголоидные

гаплогруппы (D, C, G, A, М., F). Гаплогруппа D у казахов была найдена с более высокой частотой

(17,9 %), чем у народов ВУР (у башкир 9,0 %; у татар 2,6 %). Гаплогруппы C, G встречаются с

более высокой частотой (16 %) у казахов, чем у башкир (C 11,8 % и G 4,5 %) и татар (C и G 1,8%). Гаплогруппы A, М. и F были найдены с частотами 3,25 %; 2,85%; 2,44% у казахов,

соответственно. Гаплогруппа М с большей частотой встречается в популяциях ВУР (у башкир 27,6%; у татар 8,8 %).

Европеоидные гаплогрпуппы: (H, T, J, K, U2, I, U5, HV) обнаружены у казахов с частотой

41,46 %. Гаплогруппа H составила 13 % у казахов, что меньше по сравнению с татарами ВУР: 30,7%. Частоты гаплогрупп T, J, K составили 3,3 - 4,1%. Гаплогруппа I редко встречается у казахов (0,41%), у башкир (1,4%) и у татар (0,9%). Гаплогруппы U5 (3,25%) and T (4,07%) более часто встречаются у казахов, чем у других тюркоязычных народов Сибири (0,0%), но менее часто, чем в популяциях ВУР (T 6,9% и U 25,9%). Гаплогруппы V (0,81%) и W (1,63%) с низкой частотой выявлены у казахов и в тюркоязычных популяциях: у татар (V и W 1,3%), башкир (V 2,7% и W 1,4%).

Высокий уровень генетической вариабельности мтДНК казахов можно объяснить сложным

этногенезом казахского народа. Полученные данные дают возможность изучить филогенетические корни казахов по женской линии и определить их место среди этнических групп в Европе и Азии.

ВУР - волго-уральский регион

Share this post


Link to post
Share on other sites
мы генетически очень близки к монголам.

Мы ближе к монголам чем даже к своим тюркоязычным соседям!!! Кроме того, мы в одном кластере с китайцами, японцами, и корейцами.

Наша близость с монголами в основном была предопределана большой частотой образцов с мутацией М48. М48 это основной снип маркер гаплогруппы С3, к которой принадлежит Чингисхан. Подгруппа С3 в свою очередь делится на две ветки: С* и С3с.

Ветка С* считается гипотетической веткой Темуджина. Из 54 казахов 9% образцов оказались в ветке Чингисхана.

 

Это очень интересно и важно!

Но, нельзя забывать и о гаплогруппе O3!

Мои корни по отцу уходят в Монголию, а именно к монгольскому роду Атаган.

Результаты ДНК-тестирования показали, что я - О3а5 (М134).

 

P.S. С премьерой меня на вашем форуме... :rolleyes:

Share this post


Link to post
Share on other sites
Это очень интересно и важно!

Но, нельзя забывать и о гаплогруппе O3!

Мои корни по отцу уходят в Монголию, а именно к монгольскому роду Атаган.

Результаты ДНК-тестирования показали, что я - О3а5 (М134).

 

P.S. С премьерой меня на вашем форуме... :rolleyes:

 

Привет Денис,

молодец что зашел. Как видишь, мы еще не раскочегарились.

Надеюсь что со временем нас будет здесь много.

Share this post


Link to post
Share on other sites

В будущем я планирую открыть русско-язычный спец.ресурс по гаплогруппе О3, который будет освещать историко-генетико-генеалогическую инфрмацию по группе.

Я думаю, наше знакомство будет не лишним, а содружество - полезным!

Share this post


Link to post
Share on other sites
В будущем я планирую открыть русско-язычный спец.ресурс по гаплогруппе О3, который будет освещать историко-генетико-генеалогическую инфрмацию по группе.

Я думаю, наше знакомство будет не лишним, а содружество - полезным!

 

Желаю удачи в начинании, поможем чем сможем.

Share this post


Link to post
Share on other sites

Ерлан, а вы слышали что-нибудь о Хайлар монголах (Hailar Mongol). На одном из форумов мне сказали, что О3а5 встречается у них достаточно часто.

Share this post


Link to post
Share on other sites
Ерлан, а вы слышали что-нибудь о Хайлар монголах (Hailar Mongol). На одном из форумов мне сказали, что О3а5 встречается у них достаточно часто.

 

Денис,

я мало что знаю о монголах, вам надо посетить сайт кыргыз.ру,

возможно там вам помогут с этим вопросом.

 

По поводу вашего вопросa по тюрко-монгольскому могильнику.

Скорее всего ваших предков там нет. Ваши корни явно тибетские,

и, возможно, ваши предки пришли на север Монголии позже тех захоронений.

 

Меня же поразил тот факт, что сектор С в этом могильнике является захоронением

наших казахских предков!!! Географически это легко объяснимо, но с точки зрения

ДНК-генеалогии это еще один прекрасный пример того, что все это работает!

Share this post


Link to post
Share on other sites

Чтобы было понятно о чем идет речь, расскажу об этих захоронениях более подробнее.

в 2003 году французами была опубликована работа по захоронениям в древнем могильнике на севере Монголии.

Статья здесь:

Egyin_Hal.web.pdf

 

Большинство образцов, которым более чем 2 тыс лет, были проанализированы по Y-ДНК, мт ДНК и аутосомным маркерам. Так вот, я сравнил данные по Y-ДНК с базой данных www.yhrd.org. Получилось так, что в секторе С этого могильника лежат древние предки казахов. Паспорт могилы N50 этого сектора совпал с точностью с 7 казахами из Тараза, паспорта которых имеются в базе данных yhrd.org. Кроме семи казахов, паспорт могилы N50 также совпал с паспортом одного якута, что является косвенным подтверждением того, что в секторе С лежат древние тюрки. Впрочем, о том, что сектор С является тюркским гласит и сама научная статья.

Share this post


Link to post
Share on other sites

Спасибо за информацию!

Share this post


Link to post
Share on other sites

Приведу небольшой список научных статей, которые имеют отношение (иногда косвенное) к близкой нам теме.

 

Su et al (1999) - Y-chromosome Evidence for a Northward Migration of Modern Humans into Eastern Asia during the Last Ice Age

Underhill et al (2000);

Karafet et al (2001);

Wells et al 2001,

Underhill et al (2001);

YCC (2002);

Butler (2003);

Jobling et al (2003) - THE HUMAN Y CHROMOSOME: AN EVOLUTIONARY MARKER COMES OF AGE

Kim et al 2004,

Shi et al (2005) - Y-Chromosome Evidence of Southern Origin of the East Asian-Specific Haplogroup O3-M122

Hammer et al (2005);

Hammer et al (2006) - Dual Origins of the Japanese: Common Ground for Hunter-gatherer and Farmer Y Chromosomes

Kayser et al (2006);

Sengupta et al (2006) - Polarity and Temporality of High Resolution Y-chromosome Distributions in India Identify Both Indigenous and Exogenous Expansions and Reveal Minor Genetic Influence of Central Asian Pastoralists

Gutala et al 2006,

Sahoo et al 2006,

Xue et al (2006) - Male Demography in East Asia: A North–South Contrast in Human Population Expansion Times

Wozniak et al (2006) - Allelic and haplotypic frequencies at 11 Y-STR loci in Buryats from South-East Siberia.

Gayden et al 2007.

 

 

Небольшая подборка статей по Азии:

Physical anthropology and ethnicity in Asia

Share this post


Link to post
Share on other sites

Вот ссылка на еще одну статью по древней ДНК:

Population origins in Mongolia: genetic structure analysis of ancient and modern DNA.

К сожалению, статья находится не в "бесплатном" доступе, но может ее содержание кому-нибудь пригодится? Правда она о Монголии...

 

Ерлан, если этой статье не место в данной теме - удалите мое сообщение.

Share this post


Link to post
Share on other sites
Вот ссылка на еще одну статью по древней ДНК:

Population origins in Mongolia: genetic structure analysis of ancient and modern DNA.

К сожалению, статья находится не в "бесплатном" доступе, но может ее содержание кому-нибудь пригодится? Правда она о Монголии...

 

Spasibo Denis

Share this post


Link to post
Share on other sites

Совсем скоро наша база данных пополнится вторым паспортом по аутосомным ДНК маркерам.

Достоинством этой категории маркеров является то, что она отражает не только нашу отцовскую или материнскую линию, но и всю нашу многочисленную родню. Другими словами, этот тип маркеров отражает генетическую запись этноса. Чем больше будет у нас данных по аутосомным хромосомам, тем отчетливее будет вырисовываться генетический силуэт казахского народа.

Share this post


Link to post
Share on other sites

Наш проект пополнился вторым паспортом по аутосомным маркерам.

Вскоре эти данные будут включены в общую базу данных ДНК-паспортов казахов.

Share this post


Link to post
Share on other sites

В общем, ниже приведенная история довольно хорошо освечена в СМИ, но мы как то не касались ее ранее.

 

Здесь в обобщенном виде представлены ДНК данные по аутосомным маркерам по курганам в Покровке.

Археологическими исследованиями показано, что вместе с мужчинами похоронены женщины-войны.

Захоронения относятся к сарматам, именно в среде сарматов Геродот описывал Амазонок,

женщин-войнов, которые по древним преданиям не могли родить ребенка пока не убьют одного мужчину в бою.

 

Результаты представлены группой Университета Майнц, Германия.

 

post-3-1197473173_thumb.jpg

 

 

А это фотография Мейрамгуль, казахской девочки, проживающей в Монголии.

post-3-1197473576_thumb.jpg

 

Ее ДНК совпала с ДНК амазонки под номером Pr6 в предыдущей таблице.

Отсюда был сделан вывод о том, что Мейрамгуль является потомком тех древних амазонок.

Share this post


Link to post
Share on other sites

Нашел публикацию Хитринской с соавторами (2005), которая описывает генетическую взаимосвязь между народами Центральной Азии на основе использования 9 аутосомных (расположенных в неполовых хромосомах) маркеров.

Статья свидетельствует о том, что Таджики и Узбеки относятся более к кавказоидной форме, со значительным генетическим потоком извне. Казахи и Киргизы более монголоидны, Дунгане (переселенцы из Китая) сохранили свой "китайский" генетический пул.

 

autoKazakh.pdf

Share this post


Link to post
Share on other sites
Еще одна статья по нашему региону:

 

http://www.journals.uchicago.edu/AJHG/jour.../013052.web.pdf

 

На этот раз количество образцов казахов использованных в работе было еще меньше, всего 30.

Однако, рисунок 3 снова демонстрирует генетическую близость казахов и монгол.

 

post-3-1173302279_thumb.jpg

Что за статья, кто автор, Ерлан подскажите.

Share this post


Link to post
Share on other sites

Вот список искомых статей:

0. Janica J, Pepinski W, Niemcunowicz-Janica A, Skawronska M, Aleksandrowicz-Bukin M, Ptaszynska-Sarosiek I, Koc-Zorawska E. Y-chromosome STR haplotypes and alleles in the ethnic group of Polish Tatars residing in the Northeastern Poland.

 

1. Zhu B., Li X., Wang Z., Wu H., He Y., Zhao J., Liu Y. (2005), 'Y-STRs haplotypes of Chinese Mongol ethnic group using Y-PLEX 12.', Forensic Sci Int 153(2-3), 260-3 PubMed Link DOI Link ISSN 0379-0738

 

2. Xue Y., Zerjal T., Bao W., Zhu S., Shu Q., Xu J., Du R., Fu S., Li P., Hurles ME., Yang H., Tyler Smith C. (2006), 'Male demography in East Asia: a north-south contrast in human population expansion times.', Genetics 172(4), 2431-9

 

3. Kim YJ., Shin DJ., Kim JM., Jin HJ., Kwak KD., Han MS., Choi SK., Kim W. (2001), 'Y-chromosome STR haplotype profiling in the Korean population.', Forensic Sci Int 115(3), 231-7

 

4. Kayser M., Caglia A., Corach D., Fretwell N., Gehrig C., Graziosi G., Heidorn F., Herrmann S., Herzog B., Hidding M., Honda K., Jobling M., Krawczak M., Leim K., Meuser S., Meyer E., Oesterreich W., Pandya A., Parson W., Penacino G., Perez Lezaun A., Piccinini A., Prinz M., Schmitt C., Roewer L. (1997), 'Evaluation of Y-chromosomal STRs: a multicenter study.', Int J Legal Med 110(3), 125-33, 141-9

 

5. Keyser Tracqui C., Crubezy E., Pamzsav H., Varga T., Ludes B. (2006), 'Population origins in Mongolia: genetic structure analysis of ancient and modern DNA.', Am J Phys Anthropol 131(2), 272-81

 

6. Zhu B., Wang Z., Wu Q., Sedike ME., Zhu J., Huang P., Xu Y., Liu Y. (2005), 'Genetic analysis of 15 STR loci of Chinese Uigur ethnic population', J Forensic Sci. 50(5), 1235-1236

 

7. Allelic and haplotypic frequencies at 11 Y-STR loci in Buryats from South-East Siberia.

Woźniak M, Derenko M, Malyarchuk B, Dambueva I, Grzybowski T, Miścicka-Sliwka D.

 

8. Y-chromosomal STR haplotypes in Kalmyk population samples.

Roewer L, Krüger C, Willuweit S, Nagy M, Rodig H, Kokshunova L, Rothämel T, Kravchenko S, Jobling MA, Stoneking M, Nasidze I.

 

9. Zhou R, Yang D, Zhang H, Yu W, An L, Wang X, Li H, Xu J, Xie X.

Origin and evolution of two Yugur sub-clans in Northwest China: a case study in paternal genetic landscape.

 

10. Zhu, J., Yang, G., Huang, P., and Liu, Y. (2005) Y-chromosomal STR haplotypes in Chinese Uigur ethnic group. Int J Legal Med. 119(5): 306-309.

 

11. Marchani 2008 Marchani EE, Watkins WS, Bulayeva K, Harpending HC, Jorde LB. Culture creates genetic structure in the Caucasus: autosomal, mitochondrial, and Y-chromosomal variation in Daghestan. BMC Genet. 2008 Jul 17;9:47

-

12. Regueiro 2006 Regueiro M, Cadenas AM, Gayden T, Underhill PA, Herrera RJ. Iran: tricontinental nexus for Y-chromosome driven migration. Hum Hered. 2006;61(3):132-43. Epub 2006 Jun 12

-

13. Volgyi 2008 Volgyi A, Zalan A, Szvetnik E, Pamjav H Hungarian population data for 11 Y-STR and 49 Y-SNP markers Forensic Science International: Genetics. In Press. Corrected Proof, Available online 19 June 2008 -

П.С. Буду безмерно благодарен и счастлив, если кто откликнется.

Share this post


Link to post
Share on other sites

немного о тюрках (Дагестана)

PhylogeographicAnalysis of Mitochondrial DNA in the Nogays:

A Strong Mixture ofMaternal Lineages from Eastern andWestern Eurasia

M. A. Bermisheva, I. A. Kutuev, T. Yu. Korshunova, A. Dubova, R. Villems and E. K. Khusnutdinova

http://www.ebc.ee/EVOLUTSIOON/publications...misheva2004.pdf

 

Юнусбаев Б.Б.

Популяционно-генетическое исследование народов Дагестана по данным о полиморфизме Y-хромосомы и ALU-инсерций

http://www.anrb.ru/OLD/molgen/YunusbaevBB.pdf

6f5041f686df.jpg

Share this post


Link to post
Share on other sites

Ищу статью:

http://www.nature.com/jhg/journal/v54/n1/full/jhg20082a.html

The Indian origin of paternal haplogroup R1a1* substantiates the autochthonous origin of Brahmins and the caste systemOrigin of paternal haplogroup R1a1*

Если есть у кого залейте куда-нибудь на файлообменник.

Share this post


Link to post
Share on other sites
Zhu B., Wang Z., Wu Q., Sedike ME., Zhu J., Huang P., Xu Y., Liu Y. (2005), 'Genetic analysis of 15 STR loci of Chinese Uigur ethnic population', J Forensic Sci. 50(5), 1235-1236

Очень ищу статью.

Share this post


Link to post
Share on other sites

Create an account or sign in to comment

You need to be a member in order to leave a comment

Create an account

Sign up for a new account in our community. It's easy!


Register a new account

Sign in

Already have an account? Sign in here.


Sign In Now