Sign in to follow this  
Followers 0
BatyrKZ

KZ O3

274 posts in this topic

Весьма интересно,и DYS385=11,13- это важный фрагмент данного гаплотипа.

Один вопрос снят.

Если SNP подтвердит один из субклэйдов Y-A согласно http://isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpA.html ,

то в Вашей DB,и в целом в DB KZ - появится первый "африканский алмаз". (скрестил пальцы)

 

Здоровья и успехов,Вам и DNA-команде.

 

Курметпен-с уважением,

Batyr KZO

Share this post


Link to post
Share on other sites

Думаю тут не африка а обыкновенная гомоплазия.

Share this post


Link to post
Share on other sites
Думаю тут не африка а обыкновенная гомоплазия.

Но,"Если SNP подтвердит один из субклэйдов Y-A согласно http://isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpA.html " => ...

Share this post


Link to post
Share on other sites
Но,"Если SNP подтвердит один из субклэйдов Y-A согласно http://isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpA.html " => ...

Не подтвердит снип. Его мне кажется и не делали.

Share this post


Link to post
Share on other sites
Не подтвердит снип. Его мне кажется и не делали.

Будем ждать результаты,пока подтверждения о генотипировании SNP данного гаплотипа нет.

 

Хотя в принт-скрине вверху стоит G_DYS385.

 

Так же,следуя данной критичности,необходимо подвергать сомнению все мат.предсказывания предикторов.

имхо.

Share this post


Link to post
Share on other sites

42 казакских носителя из East Kazakstan,оказались моими дальними Y-генeалогическими родственниками:

 

19 389I 389II 390 391 392 393 385 437 438 439 448 456 458 635 YGATAH4 (Alphabetical)

 

15 12 29 23 10 13 12 13,18 15 10 12 19 15 17 19 12 O3-M122 100% (YPWU)

 

http://www.ysearch.org/alphalist_view.asp?...d=GX8RH&p=0

 

GX8RH имеют матчи с EVB56-Batyr KZO.

 

Вероятно потомки Belgibai Ata.

Share this post


Link to post
Share on other sites

1) 8VY69 Kazak KZ :

 

15 11 29 22 10 12 10 11,13 1510 11 19 15 15 20 12 (A-M91 100%)

 

matches-на данный период нет.

 

2)GX8RH Kazak KZ :

 

15 12 29 23 10 13 12 13,18 15 10 12 19 15 17 19 12 (O3-M122 100%)

 

1 matches с EVB56-Batyr KZO

 

3) NGJDT Kazak KZ ,

 

15 12 29 22 10 10 11 13,18 14 10 10 22 15 16 21 11 (G2a-P15 89%)

 

matches-на данный период нет.

 

4) CVR4P Kazak KZ ,

 

14 14 31 23 11 14 14 11,13 14 14 10 19 13 17 23 11 (Q1a-MEH2 85%)

 

поиск дал два варианта:

 

I) 2 match(es) found.

 

93Q6H Andrus Troy, PA, USA Unknown Family Tree DNA 10 0 (N1c1*-M178*(xL550) 64%, YPVU)

TWGRZ Bergdahl Vinaker, Sweden Unknown Genographic Project 9 0 (N1c1*-M178*(xL550) YPVU)

 

II) 467-> match(es) found-это на сегодня рекорд,ранее было 389 матчей у Almas Sadykov KZ

 

5223A Karlsson Finland N1c1 (tested) Family Tree DNA 17 6

63CDM Valikhan Kazakhstan - Unknown Family Tree DNA 17 7

KH2TW ReiЯ Bischofstein (Bisztynek), Germany N1c1 (tested) Family Tree DNA 17 7

RT2DY Sakowicz Lithuania N1c1 (tested) Family Tree DNA 17 7

NZDK2 Semenov Tokmok, Kyrgyzstan Unknown Other - Genofond 17 8

B4NP4 Bennett England Unknown Ancestry.com 17 8

Y9A4K N1c1 DYS413b=24 Modal Lithuania Unknown Other - Derived 16 6

CTT96 Baglan Maukenov KZ Kazakhstan Unknown Family Tree DNA 16 7

5RHAW Andrei Logvinov KZ Russia Unknown Family Tree DNA 16 7

A6QSW Modal (Eastern Finland) Unknown Unknown Family Tree DNA 16 7

26SXQ Shokhan Unknown Unknown Family Tree DNA 16 7

R2CJ8 Manas Prague, Czech Republic Unknown Family Tree DNA 16 7

4WJZ4 King Tut Egypt Unknown Other - Discovery Channel 16 8

MWPSS Yakuts Modal Siberia, Sakha, Russia Unknown Other 14 6

2HVCH Gherga Turkey Unknown Genographic Project 10 2

 

возможно сбоит на исерч система.

Share this post


Link to post
Share on other sites

5) 44RXB Kazak KZ ,

 

15 11 29 22 9 12 10 13,17 15 10 12 19 15 15 20 12 (O3-M122 99%)

 

matches-на данный период нет.

 

6) QF4FK Kazak KZ ,

 

15 11 29 22 9 12 10 13,18 15 10 11 19 15 15 20 11 ( O3-M122 99%)

 

matches-на данный период нет.

 

7) TQXGH Kazak KZ ,

 

15 11 29 22 9 12 11 13,18 15 10 11 19 15 15 20 12 (O3-M122 99%)

 

matches-на данный период нет.

 

8) 55EHC Kazak KZ ,

 

15 11 31 25 12 13 11 13,18 17 12 12 23 15 18 26 11 (G1-M285 99%)

 

matches-на данный период нет.

 

9) 3CGWF Kazak KZ ,

 

15 12 28 22 9 12 10 12,16 10 10 14 20 18 15 20 11 ( J2a4-L26 66%)

 

matches-на данный период нет.

 

DYS 437 в исерч нет значения «10».

 

10) BVFBN Kazak KZ ,

 

15 12 28 23 10 13 14 13,18 10 12 15 19 15 17 19 12 (O-M175 98%)

 

matches-на данный период нет.

 

DYS 437 в исерч нет значения «10» .

Share this post


Link to post
Share on other sites
Будем ждать результаты,пока подтверждения о генотипировании SNP данного гаплотипа нет.

 

Хотя в принт-скрине вверху стоит G_DYS385.

Pavel Tarlykov:

 

"Добрый день, Batyr!

Хотел Вас немного огорчить. Мы не проводим анализ по SNP, это совсем другой вид анализа. На каждый Mаркер, характеризующий гаплогруппу необходимо заказывать отдельный зонд для Real-Time PCR. Я навскидку посмотрел, там только на гаплогруппу А около 20 таких маркеров. Эти зонды у нас в Казахстане не делают и стоят они не дешево, поэтому мы ограничиваемся только определением гаплотипа по 17 локусам. Т.е. мы оперируем гаплотипами, а не гаплогруппами.

 

G_DYS385 значит что флуоресцентная метка излучает в зеленой части спектра (Green)

 

Если появятся вопросы, буду рад ответить!"

 

Pavel, улкен ракмет - большое спасибо за пояснения!

Share this post


Link to post
Share on other sites

Попробовал сам ввести гаплотип в предиктор, который вроде как должен предсказываться как A.

Но у меня получился O3-M122 80%

Y-Filer (order 2):

11 29 22 15 15 11,13 15 15 10 19 12 10 12 10 11 20

 

Порядок Alphabetical для гаплотипов yhrd использовать крайне не удобно: придется вбивать много-много пробелов или запятых. Например, значение маркера DYS 635 тогда должно быть на 67-ом месте. Вы, как я вижу, этого не сделали. Поэтому и результат неправильный.

 

Видимо, придется добавить в предиктор еще специальный порядок Y-Filer(yhrd), чтобы гаплотипы можно было просто копировать с этой базы.

Share this post


Link to post
Share on other sites

Спасибо.

Share this post


Link to post
Share on other sites
Попробовал сам ввести гаплотип в предиктор, который вроде как должен предсказываться как A.

Но у меня получился O3-M122 80%

Y-Filer (order 2):

11 29 22 15 15 11,13 15 15 10 19 12 10 12 10 11 20

 

Порядок Alphabetical для гаплотипов yhrd использовать крайне не удобно: придется вбивать много-много пробелов или запятых. Например, значение маркера DYS 635 тогда должно быть на 67-ом месте. Вы, как я вижу, этого не сделали. Поэтому и результат неправильный.

 

Видимо, придется добавить в предиктор еще специальный порядок Y-Filer(yhrd), чтобы гаплотипы можно было просто копировать с этой базы.

Vadim,добрый день,

ракмет,что оперативно откликнулись на просьбу понять ситуцию с "А".

 

Действительно,сегодня при загрузке в Alphabetical со следующей последовательностью:

19 385 389I 389II 390 391 392 393437 438 439 448 456 458 635 YGT4 (Alphabetical),

получил O3-M122 85%.

 

Скажите,поскольку DYS в предикторе динамичное,могла ли тогда при моей загрузке стоять указанная на тот день последовательность:

 

19 389I 389II 390 391 392 393 385 437 438 439 448 456 458 635 YGT4 (Alphabetical),

т.к. когда я зашел в предиктор,я выбрал из всех вариантов именно удобоваримую на тот момент (Alphabetical),и выстроил последовательность,загрузив как указано выше,и лишь переставил вперед значение DYS437 в отличии от последовательности yhrd. Все DYS, и 635 в т.ч.,после конвертации,соответствовали своим гнездам. Результат был эдентичен с полученным ув.Nimissin :"Предиктор Вадима однозначно (100 %) определяет по нему гаплогруппу О3-М122". Мой результат :" N Haplogroup Probability

1) O3-M122 100%"

 

Практически одномоментно с Жаксылыком при такой последовательности мы получали одинаковые результаты того дня...

 

Если не возражаете,пeрезагружу позже все гаплотипы заново,и задам появившиеся вопросы.

 

Еще раз,большое спасибо за консультацию.

 

Курметпен-с уважением,

Batyr KZO.

Share this post


Link to post
Share on other sites

В начале было YHRD:

19 389I 389II 390 391 392 393 385 438 439 437 448 456 458 635 YGAT4 ( yhrd )

15 12 29 23 10 13 12 13,18 10 12 15 19 15 17 19 12

15 12 29 22 10 10 11 13,18 10 10 14 22 15 16 21 11

14 14 31 23 11 14 14 11,13 14 10 14 19 13 17 23 11

15 11 29 22 9 12 10 13,17 10 12 15 19 15 15 20 12

15 11 29 22 9 12 10 13,18 10 11 15 19 15 15 20 11

15 11 29 22 9 12 11 13,18 10 11 15 19 15 15 20 12

15 11 29 22 10 12 10 11,13 10 11 15 19 15 15 20 12

15 11 31 25 12 13 11 13,18 12 12 17 23 15 18 26 11

15 12 28 22 9 12 10 12,16 10 10 14 20 18 15 20 11

15 12 28 23 10 13 14 13,18 10 12 15 19 15 17 19 12

-------

в соотвествии с Alphabetical

19 385 389I 389II 390 391 392 393 437 438 439 448 456 458 635 YGT4 (Alphabetical)

15 13,18 12 29 23 10 13 12 15 10 12 19 15 17 19 12

15 13,18 12 29 22 10 10 11 14 10 10 22 15 16 21 11

14 11,13 14 31 23 11 14 14 14 14 10 19 13 17 23 11

15 13,17 11 29 22 9 12 10 15 10 12 19 15 15 20 12

15 13,18 11 29 22 9 12 10 15 10 11 19 15 15 20 11

15 13,18 11 29 22 9 12 11 15 10 11 19 15 15 20 12

15 11,13 11 29 22 10 12 10 15 10 11 19 15 15 20 12

15 13,18 11 31 25 12 13 11 17 12 12 23 15 18 26 11

15 12,16 12 28 22 9 12 10 14 10 10 20 18 15 20 11

15 13,18 12 28 23 10 13 14 15 10 12 19 15 17 19 12

Share this post


Link to post
Share on other sites

Результат :

N Haplogroup Probability

1 O3-M122 100%

2 J2a4-L26 74%

3 N1c1*-M178*(xL550) 81%

4 O3-M122 79%

5 O3-M122 68%

6 O3-M122 90%

7 O3-M122 85%

8 G1a*-P20(xL201) 63%

9 J2a4-L26 75%

10 O3-M122 100%

elim.kz

Share this post


Link to post
Share on other sites

Уважаемый Vadim,добрый день,

 

будет ли Робот Вертнера сотрудничать с DB YHRD - 37,где в н.в. " 97575 гаплотипов из 108 стран" .

Share this post


Link to post
Share on other sites

Delay in Results for Kit#: 151040

 

A very small percentage of the tests we perform do not return conclusive results the first time we test. In these cases, the samples do not produce a reading that allows our lab to determine with 100% certainty the values for one or more markers or regions. When this happens, we re-test the sample. We repeat this procedure up to 3 times after the initial test fails to give a clear result.

 

Your sample failed to produce a clear result in this run. Below is a status update for your kit number, 151040, as well as an estimated time of when the next rerun is expected to be completed:

 

MP8 - 8/22/2011 This test failed to yield results for your sample. Your sample is being rerun now. Results from this round of testing are expected by this date.

 

Family Tree DNA

http://www.FamilyTreeDNA.com

info@familytreedna.com

The world's first and largest Genetic Genealogy organization

Share this post


Link to post
Share on other sites

Задержка в Результаты Kit #: 151040

 

Очень маленький процент тесты мы проводим не возвращаются убедительных результатов в первый раз мы тестируем. В этих случаях образцы не производят чтение, что позволяет нашей лаборатории, чтобы определить со 100% уверенностью значения для одного или более маркеров или регионах. Когда это происходит, мы повторно тестировать пробы. Мы повторяем эту процедуру до 3 раз после первоначального испытания не дает четкий результат.

 

Ваш пример не дали четкий результат в этой перспективе. Ниже обновление статуса для вашего комплекта номер 151040, а также предполагаемое время, когда следующий перезапустить как ожидается, будет завершен:

 

MP8 - 8/22/2011 Этот тест не дал результатов для вашего образца. Ваш образец в настоящее время повторно сейчас. Результаты этого раунда тестирования ожидаются к этой дате.

Share this post


Link to post
Share on other sites

Batyrzhan Daulet KZ

 

Displaying User ID: D7SD7 , Y-67

 

7 Ata: O*->O-M175->Naiman->matai->kenzhe->Zheti Su,Sarkand,Tentek,Taldy Korgan,Almaty->Raimkozha->Daulet->Sabyrbek->Batyrzhan Sabyrbekuly Daulet KZ,к.э.н.,PhD->Ashim Batyrzhanuly Daulet KZ->kazak->Кazakstan-KZ

 

PANEL 1 (1-12)

Locus 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12

DYS# 393 390 19* 391 385a 385b 426 388 439 389-1 392 389-2

Alleles 12 23 15 10 13 18 11 12 12 12 13 29

 

PANEL 2 (13-25)

Locus 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25

DYS# 458 459a 459b 455 454 447 437 448 449 464a** 464b** 464c** 464d**

Alleles 17 9 9 11 11 32 15 19 35 13 13 13 15

 

PANEL 3 (26-37)

Locus 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37

DYS# 460 GATA H4 YCA II a YCA II b 456 607 576 570 CDY a CDY b 442 438

Alleles 9 11 19 21 15 18 19 17 35 38 12 10

 

PANEL 4 (38 - 47)

Locus 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47

DYS# 531 578 395S1a 395S1b 590 537 641 472 406S1 511

Alleles 11 10 15 17 8 12 7 8 11 10

 

PANEL 4 (48 - 60)

Locus 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60

DYS# 425 413a 413b 557 594 436 490 534 450 444 481 520 446

Alleles 12 17 17 17 11 12 12 17 7 12 22 17 12

 

PANEL 4 (61 - 67)

Locus 61 62 63 64 65 66 67

DYS# 617 568 487 572 640 492 565

Alleles 13 10 15 11 11 12 11

Share this post


Link to post
Share on other sites

Re: Гаплотипы O, найденные автоматически

 

« 13:58:22 »

 

Робот Вертнера :

 

 

Субклад O3, O; Batyrzhan KZ; Kazakstan; 151040 (на расстоянии 4 от O3a3c; O3; Belgibai; Kazakstan; QDUG4 80057)

 

 

http://forum.molgen.org/index.php/topic,18...g95677.html#new

Share this post


Link to post
Share on other sites

Хороший хабар:

Y-DNA haplogroup Deep Clade test results have been posted for kit 151040, Daulet Batyrzhan KZ.

elim.kz

12 23 15 10 13 18 11 12 12 12 13 29: O3а3с-М134+,M117-,M162-,P101- .. -> naiman->matai->kenzhe->Batyrzhan Daulet KZ->kazak->KZ->D7SD7

Share this post


Link to post
Share on other sites

Спасибо за дип.

Share this post


Link to post
Share on other sites
Спасибо за дип.

Служу KZ.

Share this post


Link to post
Share on other sites

Интересно каково происхождения данный субклад, у китайцев он 11 % в среднем имеет.

А на севере Китая до 14 % доходит.

Share this post


Link to post
Share on other sites
Интересно каково происхождения данный субклад, у китайцев он 11 % в среднем имеет.

А на севере Китая до 14 % доходит.

elim.kz

Y - Haplotree / My Matches

Exact Matches

O3a3c Kazakstan - 2

2-Step Mutations

O3a Taiwan, Province of China Han 1

O3a3 China Manchu 1

O3a3c Kazakstan - 1

3 -Step Mutations

O3a3c China Han 2

O3a3c Japan - 2

O3a3c Kazakstan - 1

O3a3c Taiwan, Province of China Han 1

4 -Step Mutations

O3a3c China Chinese Ethnic Minority 2

O3a3c China Han 1

O3a3c China Tibet 1

O3a3c Japan - 1

O3a3c Korea, Republic of - 1

O3a3c Mongolia - 4

O3a3c Taiwan, Province of China Han 1

PRоисхождение - ЮВА.

Share this post


Link to post
Share on other sites

Batyrzhan Daulet KZ

Displaying User ID: D7SD7 , Y-111 -второй 111-маркерный гаплотип в KZ DNA

7 Ata: O*->O-M175->O3а3с-М134+,M117-,M162-,P101"-" -> Naiman->matai->kenzhe->Zheti Su,Sarkand,Tentek,Taldy Korgan,Almaty->Raimkozha->Daulet->Sabyrbek->Batyrzhan Sabyrbekuly Daulet KZ,к.э.н.,PhD->Ashim Batyrzhanuly Daulet KZ->kazak->Кazakstan-KZ

(1-12)

Locus 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12

DYS# 393 390 19* 391 385a 385b 426 388 439 389-1 392 389-2

Alleles 12 23 15 10 13 18 11 12 12 12 13 29

PANEL 2 (13-25)

Locus 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25

DYS# 458 459a 459b 455 454 447 437 448 449 464a** 464b** 464c** 464d**

Alleles 17 9 9 11 11 32 15 19 35 13 13 13 15

PANEL 3 (26-37)

Locus 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37

DYS# 460 GATA H4 YCA II a YCA II b 456 607 576 570 CDY a CDY b 442 438

Alleles 9 11 19 21 15 18 19 17 35 38 12 10

PANEL 4 (38 - 47)

Locus 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47

DYS# 531 578 395S1a 395S1b 590 537 641 472 406S1 511

Alleles 11 10 15 17 8 12 7 8 11 10

PANEL 4 (48 - 60)

Locus 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60

DYS# 425 413a 413b 557 594 436 490 534 450 444 481 520 446

Alleles 12 17 17 17 11 12 12 17 7 12 22 17 12

PANEL 4 (61 - 67)

Locus 61 62 63 64 65 66 67

DYS# 617 568 487 572 640 492 565

Alleles 13 10 15 11 11 12 11

PANEL 5 (68 - 75)

Locus 68 69 70 71 72 73 74 75

DYS# 710 485 632 495 540 714 716 717

Alleles 33 15 8 14 12 27 27 19

PANEL 5 (76 - 85)

Locus 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85

DYS# 505 556 549 589 522 494 533 636 575 638

Alleles 11 11 12 12 12 9 10 11 10 11

PANEL 5 (86 - 93)

Locus 86 87 88 89 90 91 92 93

DYS# 462 452 445 GATA A10 463 441 GGAAT 1B07 525

Alleles 12 30 12 12 22 14 9 9

PANEL 5 (94 - 102)

Locus 94 95 96 97 98 99 100 101 102

DYS# 712 593 650 532 715 504 513 561 552

Alleles 21 16 20 12 23 15 14 15 24

PANEL 5 (103 - 111)

Locus 103 104 105 106 107 108 109 110 111

DYS# 726 635 587 643 497 510 434 461 435

Alleles 12 19 19 14 14 17 9 12 11

Share this post


Link to post
Share on other sites

Create an account or sign in to comment

You need to be a member in order to leave a comment

Create an account

Sign up for a new account in our community. It's easy!


Register a new account

Sign in

Already have an account? Sign in here.


Sign In Now
Sign in to follow this  
Followers 0